לאחר שעות ארוכות של חיפושים, שהחלו בשישי בבוקר, נמצאה גופתו של הנער בנימין אחימאיר (14) סמוך למאחז מלאכי השלום. אחימאיר יצא ביום שישי בבוקר לרעות את עדר הצאן ולא שב. שב״כ והמשטרה הודיעו כי אחימאיר "נרצח בפיגוע טרור וחקירת האירוע נמשכת". כוחות הביטחון ממשיכים במרדף אחר החשודים בביצוע הפיגוע.
על פי ממצאים מזירת הפיגוע, בנימין ז"ל נאבק במחבל, או המחבלים, לפני שנרצח. גורמי הביטחון הסבירו כי הזירה הייתה "פרוסה". כלומר, המאבק של בן ה-14 במחבלים התנהל לאורך כמה מטרים. חלק מפרטי הלבוש של אחימאיר היו מפוזרים ליד גופתו.
אליהו ליבמן, ראש מועצת קריית ארבע, אשר בנו, אליקים, חטוף בעזה, הגיע לסייע בחיפושים. ליבמן סיפר על מציאת גופתו של הנער כי "מדובר ברצח אכזרי ביותר. רחפן של הצבא זיהה משהו חריג, שלח נקודת ציון שהגיעה אלינו, היינו בקרבת מקום בסריקות והלכנו לחפש בנקודה שקיבלנו ולצערנו, מצאנו את הנער. זה היה ממש קרוב לנקודה ממנה בנימין ז"ל יצא. היה מראה מזעזע ביותר. הראש היה מעוך מאבן גדולה מלאה בדם. 3 מטר ליד היתה סכין עם דם ועוד אבן עם דם, והפלאפון שלו היה ליד שבור ומנופץ. ממש אכזריות. זירה קשה ביותר".
בינתיים ממשיכים גורמי החקירה של שב"כ, צה"ל והמשטרה בחקירת הרצח, כשבמקביל יש צו איסור פרסום על כל פרט העלול לזהות את החשודים. גורמים המעורבים בחקירה אספו ממצאים חשובים מהזירה שיכולים לשפוך אור על זהות החשודים. מלבד זאת, נעשה שימוש באמצעים טכנולוגיים נרחבים כדי להתחקות אחר נתיב בריחת המחבל או המחבלים. "אנחנו משתמשים בכל היכולות שיש לנו, נגיע למחבלים. זה רק עניין של זמן".
הערב (ראשון) נערכה לווייתו בבית העלמין בהר המנוחות בירושלים. אימו של בנימין, מרים, ספדה לבנה: "כמה לב היית, תמיד חשבת על אחרים. לקחת את כולם בחשבון ודאגת לא להעליב אף אחד. חבשת על הראש שלך כיפה מגניבה עם פונפון, אמרתי לך 'תשמור עליה'. היא ספוגה בדמעות שלי". אחיו אבינועם הוסיף: "ביני, אח שלי המתוק והאהוב, אתה כזה גבר. היית הרוח החיה בבית, איחדת את כולם. תמיד רצית שנטייל איתך. תמיד היית עוזר לי. כל פעם שהיית חוזר היית מכין ארוחות ואומר לי 'בוא תאכל'".
רחל, אחותו של בנימין, ספדה לאחיה: "ביני היקר שלנו, ילד יפה ואהוב שכולו לב אחד גדול שהאיר את העולם ואת כולנו. נגעת בכל כך הרבה אנשים בטוב הלב שלך ובאהבה שלך. הייתי פשוט אדם של 100% טוב, טוהר ופשטות. כל מה שרצית היה פשוט לאהוב ולחיות, היית האדם הכי חי שאני מכירה".
במוצאי שבת כתב ראש הממשלה בנימין נתניהו: "הרצח המתועב של הנער בנימין אחימאיר הי״ד הוא פשע חמור. אני שולח תנחומים מעומק הלב למשפחתו". נשיא המדינה יצחק הרצוג: "ליבנו דואב בכאב על הירצחו של בנימין אחימאיר ז״ל, רק בן 14, שחייו נגדעו בידי בני עוולה. בשעה קשה זו אני מבקש לשלוח תנחומים למשפחתו, אוהביו ואהוביו.
יו״ר הציונות הדתית, שר האוצר, בצלאל סמוטריץ׳, אמר: "עצובים וכואבים עם הבשורה הנוראה על הרצח המתועב של בנימין הי״ד. יש לנו עסק עם נאצים. נאצים בעזה ונאצים ביהודה ושומרון. ככל שנבין זאת מוקדם יותר, ונשכיל לפעול נגד האויב ביד קשה יותר, נצליח להשיב את ההרתעה מול האויב השפל. תנחומים מעומק הלב למשפחת אחימאיר, עם ישראל כולו בוכה ואבל יחד איתכם. אל מול המחבלים המבקשים לפגוע בהתיישבות ובאחיזתנו בחבלי המולדת ובעם ישראל, אנחנו מחזקים במעשים את המחויבות שלנו להתיישבות בכל חבלי ארץ ישראל".
לאחר שנודע על מציאת הגופה נכנסו קבוצות יהודים לכפרים פלסטיניים סמוכים, תקפו תושבים והבעירו בתים וכלי רכב. דובר צה"ל אישר שפלסטיני נהרג בתקיפות אלו. גם צלם של אתר ynet הותקף ונפצע.
במוצ"ש, לאחר שנודע דבר הימצא גופתו של אחימאיר ז"ל, הפגינו למעלה מ1500 תושבים בכ40 צמתים ביהודה ושומרון, במחאה על הרצח המזעזע. בניסיון למגר את המחאה הוציא צה"ל צווי שטח צבאי סגור למספר צמתים. מטה נלחמים על החיים: "אנחנו במלחמה על מלא, הציבור לא מוכן יותר לשבת בבית". ההפגנות נערכו, בין היתר, בצומת קרית ארבע, כיכר אדם, כפר אדומים, צומת כוכב השחר, צומת יקיר, צומת תפוח, צומת עפרה, צומת הדואר, כיכר נבי אליאס, צומת אריאל ועשרות צמתים נוספים. מוקדם יותר היום במהלך השבת בוצעו חסימות נרחבות על ידי מאות תושבים מישובי האזור ביציאות מהכפרים הסמוכים למקום האירוע, לאחר שצה"ל סירב לבצע בידוקים וחסימות חרף החשש לחטיפה או הימלטות של המרצחים.
במטה "נלחמים על החיים" אמרו: "אנחנו במלחמה על מלא. הציבור ביהודה ושומרון הבין זאת על בשרו, ומסרב לשבת בבית ולצפות בתדהמה בחוסר התפקוד והבלבול העמוק של מערכת הביטחון שעדיין שרויה עמוק בקונספציה – וגם בשעה זו מסרבת לפעול כנגד הנאצים בכפרי האזור כמו שאמורים לפעול במלחמה כנגד אויב. התקווה שלנו הערב היא הציבור שמבין את המצב ויוצא בהמוניו לחסום את המחבלים. המערכה הגדולה של עם ישראל עוד לפנינו אבל בעז"ה נעמוד בה בגבורה".
